ユーザーに割り当てをする場合、複数の科目に対して一括割り当てを行いたい。

サイト内の操作によって、複数の科目に一度に割り当て設定を行う機能はありません。
代わりに、CSVファイルによる割り当て設定のインポート機能がありますので、利用してみてください。